Simple-quantitative-DNA-analysis

用于对单个DNA条带进行简单的DNA定量分析脚本

使用方法

1. 准备含有DNA条带的图片(png, jpg)，示例：

2. 创建一个txt文件，写入ug梯度，示例：

3. 在命令地址行输入命令： 语法：python rgbcolorContoursInside2.0.py [样品数目] [DNA条带图片] [含有梯度txt文件]

示例：python rgbcolorContoursInside2.0.py 5 con1.txt origin.jpg

4. 对图片进行裁剪，左键拖动框框至合适位置，关闭窗口。

输出

类别： 含有识别出条带轮廓的csv坐标文件

算出坐标内的RGB数值的csv文件

识别出轮廓效果的jpg文件

经过图像增强（图像增强只为获取条带轮廓坐标点）的单个条带的png文件

计算出条带亮度的ex1data3.txt文件

计算出条带亮度并画图的jpg文件(含折线图以及聚类算法分类出的点状DNA坐标图)