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tobiasrausch · Mar 18, 2024 · 3b992ce · 3b992ce
1 parent cd1af69
commit 3b992ce
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diff --git a/src/pct.h b/src/pct.h
@@ -221,7 +221,7 @@ namespace lorax
       uint32_t qsublen = querySubLength(rec);
       uint32_t qlen = sequenceLength(rec);
       double pctval = (double) (match) / (double) qsublen;
-      ofile << bam_get_qname(rec) << '\t' << rec->core.qual << '\t' << qlen << '\t' << qsublen << '\t' << pctval << '\t' << largestdel << '\t' << largestins << "\taligned\t" << match << '\t' << mismatch << '\t' << del << '\t' << delsize << '\t' << ins << '\t' << inssize << '\t' << sc << '\t' << scsize << '\t' << hc << '\t' << hcsize << std::endl;
+      ofile << bam_get_qname(rec) << '\t' << (int32_t) (rec->core.qual) << '\t' << qlen << '\t' << qsublen << '\t' << pctval << '\t' << largestdel << '\t' << largestins << "\taligned\t" << match << '\t' << mismatch << '\t' << del << '\t' << delsize << '\t' << ins << '\t' << inssize << '\t' << sc << '\t' << scsize << '\t' << hc << '\t' << hcsize << std::endl;
     }
     if (seq != NULL) free(seq);
     ofile.close();